som styrer handlingen. -c, -C, --complement bruk komplementæren for SETT1 -d, --delete slett tegn i SETT1, og ikke oversett -s, --squeeze-repeats erstatt hver inndata-sekvens med et gjentatt tegn basert på et som forekommer én gang i sist valgt SETT -t, --truncate-set1 forkort SETT1 til samme lengde som SETT2 først